1、利用天敌防治有害生物，这种方法比较普遍。因为每种害虫都有1种或几种天敌，使用这种方法可以有效抑制害虫大量繁殖，而且这种抑制作用是生态系统反馈机制重要的组成部分，利用这一生态学现象，可以使生物种群之间建立平衡关系。
2、选育具有抗性的作物品种防治病虫害。比如选育抗马铃薯晚疫病的马铃薯品种、抗花叶病的甘蔗品种，抗镰刀菌枯萎病的亚麻品种、抗麦杆蝇的小麦品种等。
3、耕作防治，这种方法主要是改变农业环境，减少有害生物发生。比如搜集或培养大量有害昆虫，然后用γ射线或化学不育剂使它们成为不育个体，再将它们释放出去与野生害虫交配，使其后代失去繁殖能力。
